在細菌細胞中,某種特定質(zhì)粒的數(shù)目。根據(jù)復(fù)制特性,質(zhì)粒分嚴緊型和松弛型兩類,前者在細胞中只含1~2個,而后者含10~15個以上。恒定的拷貝數(shù)與質(zhì)粒復(fù)制控制系統(tǒng)、宿主細胞遺傳背景及生長條件有關(guān)。質(zhì)粒復(fù)制控制系統(tǒng)首先通過調(diào)節(jié)復(fù)制的起始點來控制拷貝數(shù),調(diào)節(jié)因素包括阻遏...
嵌合抗原受體(Chimericantigenreceptor,CAR)-T細胞(CAR-T)是指通過基因修飾技術(shù),使用病毒等載體將帶有特異性抗原識別結(jié)構(gòu)域、鉸鏈區(qū)、跨膜區(qū)、共刺激信號jihuo區(qū)等遺傳物質(zhì)轉(zhuǎn)入自體或異體T細胞形成的。CAR-T回輸?shù)交颊唧w內(nèi)后,...
使用CRISPR/Cas9、ZFNs和TALENs等設(shè)計核酸酶進行基因組編輯,可以將遺傳物質(zhì)定向?qū)氩溉閯游锘蚪M的特定位點。然而,可能會出現(xiàn)非預(yù)期的靶上和靶外基因組修飾,這可能導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定,并破壞正?;虻墓δ?,從而可能導(dǎo)致臨床前和臨床研究中的安全問題。...
一般情況下重組載體基因較少整合到基因組中,但近年來已發(fā)現(xiàn)載體基因整合到特定基因座中導(dǎo)致的可能性。建議設(shè)計時充分考慮重組載體的安全性,關(guān)注目的基因的啟動子選擇、給藥劑量、整合區(qū)域等多種相關(guān)因素。建議對病毒載體進行全基因組測序。另外,也可將病毒載體轉(zhuǎn)導(dǎo)目標細胞后,...
全基因組測序是對重組細胞的基因組DNA進行深度測序,技術(shù)成熟簡單這里不做介紹了,我們分享一下LM-PCR結(jié)合二代測序的檢測方法。LM-PCR全稱連接介導(dǎo)的PCR。將含有慢病毒插入的基因組進行隨機打斷并連接接頭,然后通過兩輪PCR富集含有慢病毒LTR-宿主區(qū)域的...
基因zhiliao產(chǎn)品特有的可能會引起遲發(fā)性不良反應(yīng)的風(fēng)險因素包括:基因組整合活性基因zhiliao產(chǎn)品可能會采用修飾宿主基因組的技術(shù),并有可能在宿主細胞或組織中持續(xù)存在。很多基因zhiliao載體的基因整合不會指向基因組的特定位點,可能在整合位點處產(chǎn)生插入突...
質(zhì)粒的不相容性通俗來說,就是一山不能容二虎。但是作為科學(xué)來說,我們需要一個嚴謹?shù)亩x?!袄猛粡?fù)制系統(tǒng)的兩個質(zhì)粒會在復(fù)制和隨后向自細胞的分配過程中彼此競爭,這樣的質(zhì)粒在細菌培養(yǎng)物中不能和平共處,這種現(xiàn)象稱之為不相容性”。那要怎么才能在一個菌里面使用兩個質(zhì)粒呢...
給藥間隔,對于shou次在人體中開展臨床試驗(firstinhuman,FIH)的免疫細胞zhiliao產(chǎn)品,采用受試者間隔給藥的方式,可以避免多個受試者同時暴露而出現(xiàn)預(yù)期外的安全性風(fēng)險。在FIH試驗中,對首例患者應(yīng)加強不良事件監(jiān)測,還要考慮遲發(fā)性不良事件。向...
應(yīng)用場景:單克隆抗體藥物輔助篩選;致xingbing毒整合位點檢測與整合偏好性分析等;WGS不適用于轉(zhuǎn)染之后未經(jīng)過傳代培養(yǎng)和表型篩選的細胞系。豐富的項目經(jīng)驗?zāi)壳?,唯可已與國內(nèi)外多家免疫zhiliao研究前沿企業(yè)開展合作,采用該方法對高度異質(zhì)性的CAR-T細胞進...
插入突變風(fēng)險評估一些整合性載體(如逆轉(zhuǎn)錄病毒、慢病毒、轉(zhuǎn)座子)可將外源基因插入整合到細胞基因組中,這可能會導(dǎo)致關(guān)鍵基因突變或jihuo原基因,從而導(dǎo)致惡性liu風(fēng)險增加。影響插入突變的關(guān)鍵風(fēng)險因素包括:(1)載體的整合特征,如插入位點的偏好性;(2)載體的設(shè)計...
質(zhì)粒載體的分類:按復(fù)制形式:分為嚴緊型和松弛型復(fù)制。根據(jù)質(zhì)粒DNA復(fù)制與宿主之間的關(guān)系或在宿主細胞的拷貝數(shù)的多少,可以將質(zhì)粒分為兩種不同的復(fù)制類型:嚴緊型和松弛型。嚴緊型質(zhì)粒復(fù)制受宿主染色體DNA復(fù)制的嚴格控制,拷貝數(shù)較小一般只有1~3個拷貝。疏松型質(zhì)粒的復(fù)制...
BLESS:利用生物素標簽對DSBs進行原位標記,后經(jīng)PCR擴增實現(xiàn)對于生物素標記片段的富集,并通過二代測序?qū)崿F(xiàn)脫靶位點檢測。直接檢測細胞中的切割位點,靈敏度與細胞、組織密切相關(guān)。LAM-HTGTS,片段化的gDNA經(jīng)過LAM-PCR引入接頭,然后進行全基因組...
如果免疫細胞zhiliao產(chǎn)品擬與其他藥物或zhiliao方法聯(lián)合zhiliao,有必要通過探索性試驗觀察聯(lián)合zhiliao的安全和耐受性,以及其他藥物或zhiliao方法對免疫細胞zhiliao產(chǎn)品體內(nèi)活性、增殖或存活、給藥頻率等的影響。如果免疫細胞zhil...
基因重排或重組。當(dāng)基因zhiliao產(chǎn)品所用載體及其攜帶的基因發(fā)生復(fù)制時,可能出現(xiàn)非zhiliao目的非預(yù)期的基因表達或改變,或者與相應(yīng)野生型或輔助病毒互補后產(chǎn)生回復(fù)突變或意外復(fù)制或形成6新的病毒。免疫原性。由于基因zhiliao產(chǎn)品在體內(nèi)的持續(xù)暴露或者需要多...
降低CRISPR脫靶效應(yīng),你可以做什么?CRISPR技術(shù)是一種簡單而強大的編輯基因組的工具。它使研究人員能夠輕松地改變DNA序列并修改基因功能。它的許多潛在應(yīng)用包括糾正遺傳缺陷,zhiliao和預(yù)防疾病的傳播,以及改善農(nóng)作物。在流行的用法中,CRISPR是CR...
基因編輯定量脫靶檢測:基因編輯定量脫靶檢測,使用CRISPR/Cas9、ZFNs和TALENs等設(shè)計核酸酶進行基因組編輯,可以將遺傳物質(zhì)定向?qū)氩溉閯游锘蚪M的特定位點。然而,可能會出現(xiàn)非預(yù)期的靶上和靶外基因組修飾,這可能導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定,并破壞正?;虻墓δ?..
用低拷貝質(zhì)粒作表達載體有什么好處?因為高拷貝質(zhì)粒穩(wěn)定性低,而且給宿主細胞的壓力大。低拷貝數(shù)的質(zhì)粒DNA在宿主細胞分裂前只能復(fù)制1~2次,而多拷貝數(shù)質(zhì)??梢栽诩毎至亚皬?fù)制成10~200拷貝。高拷貝數(shù)的質(zhì)粒稱為松弛型質(zhì)粒(relaxedplasmid),單獨于細...
CRISPR/Cas9的問題:和TALEN和ZFNS技術(shù)一樣,CRISPR/Cas9技術(shù)在應(yīng)用時也存在一定概率的脫靶問題——Cas9核酸酶在非目標位點發(fā)生切割,引入非預(yù)期的基因突變。脫靶切割引入的突變可能會直接破壞細胞的基本功能,帶來不可預(yù)控的嚴重后果。如何減...
γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒載體(RetroviralVector):早期臨床試驗曾發(fā)現(xiàn),逆轉(zhuǎn)錄病毒對造血干細胞進行基因改造回輸人體后誘導(dǎo)了的發(fā)生。目前對逆轉(zhuǎn)錄病毒載體的臨床使用安全性仍在探索中,建議謹慎使用γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒載體進行分裂活躍的干細胞類產(chǎn)品的基因編輯。慢病毒載體...
不論在科研還是臨床中,CRISPR技術(shù)的使用都帶來了非常高的回報,也同時伴隨著各種風(fēng)險,這其中脫靶現(xiàn)象就研究者們較為擔(dān)心的一類風(fēng)險。本文中我們盤點了多種主流的CRISPR脫靶位點檢測方法,但沒有一種方法是適用于所有CRISPR技術(shù)的脫靶檢測,一個項目中只使用一...
在開展除惡性liu外其他適應(yīng)癥的臨床研究時,每一劑量水平的受試者數(shù)量還應(yīng)考慮不同適應(yīng)癥人群對風(fēng)險的可接受程度,或者安全性的評價要求,可能需要通過更大的樣本量提供更充分的安全性信息。此外,其他研究目的,如耐受性、制備可行性和藥理學(xué)活性評估,也可能影響樣本量或劑量...
ddPCR與qPCR在監(jiān)測CART細胞拷貝數(shù)靈敏度比較,CAR-T細胞免疫zhiliao發(fā)展迅速,CAR-T細胞zhiliao后的動力學(xué)監(jiān)測對患者隨訪至關(guān)重要,對指導(dǎo)接受CAR - T細胞zhiliao的患者的臨床決策也很重要。在給藥前,CAR - T細胞產(chǎn)品...
CIRCLE-Seq,將gDNA打斷并環(huán)化,環(huán)化的DNA與CRISPR/RNP孵育,NGS測序檢測線性化的DNapian段,確定脫靶位點。PCR富集后測序,成本相對較低,能檢測低頻脫靶突變。安必奇sgRNA脫靶效應(yīng)評估,安必奇生物提供sgRNA脫靶效應(yīng)評估服務(wù)...
全基因組測序是對重組細胞的基因組DNA進行深度測序,技術(shù)成熟簡單這里不做介紹了,我們分享一下LM-PCR結(jié)合二代測序的檢測方法。LM-PCR全稱連接介導(dǎo)的PCR。將含有慢病毒插入的基因組進行隨機打斷并連接接頭,然后通過兩輪PCR富集含有慢病毒LTR-宿主區(qū)域的...
流式檢測CAR+T細胞數(shù)量,較,作者用FC流式評估了用axis-cel和tisasa-celzhiliao的患者的CAR+T細胞的數(shù)量。在CAR-T細胞給藥后5個不同時間點冷凍的PBMCs上對UPN#009(軸細胞)和UPN#020(組織細胞)進行了回顧性FC...
實時熒光定量PCR,其定量的基本原理是在PCR反應(yīng)體系中加入非特異性的熒光染料(如:SYBRGREENI)或特異性的熒光探針(如:Taqman探針),實時檢測熒光量的變化,獲得不同樣品達到一定的熒光信號(閾值)時所需的循環(huán)次數(shù):CT值(CycleThresho...
插入突變風(fēng)險評估一些整合性載體(如逆轉(zhuǎn)錄病毒、慢病毒、轉(zhuǎn)座子)可將外源基因插入整合到細胞基因組中,這可能會導(dǎo)致關(guān)鍵基因突變或jihuo原基因,從而導(dǎo)致惡性liu風(fēng)險增加。影響插入突變的關(guān)鍵風(fēng)險因素包括:(1)載體的整合特征,如插入位點的偏好性;(2)載體的設(shè)計...
誘導(dǎo)多能干細胞來源的細胞產(chǎn)品。誘導(dǎo)多能干細胞(inducedpluripotentstemcell,iPS)自身具有致瘤性風(fēng)險,在體內(nèi)可形成畸胎瘤,整合病毒載體的使用和誘導(dǎo)多能性可能增加iPS細胞插入致突變性和致性的風(fēng)險。因此,應(yīng)在shou次臨床試驗前完成...
慢病毒整合事件要素及檢測方法要求:對于食藥監(jiān)局指導(dǎo)性文件和既往研究內(nèi)容,我們不難發(fā)現(xiàn)對于慢病毒整合檢測所謂整合事件至少包含三個要素:整合位置;整合方向;特定整合位置和整合方向的juedui克隆數(shù)目;因此檢測在定性和定量性能方面都有要求,檢測方法需要結(jié)合臨床樣本...
在細菌細胞中,某種特定基因的數(shù)目。一般檢測方法有若是測序結(jié)果,可選用censor軟件檢測相關(guān)拷貝數(shù)。Southernblot是一種常用的DNA定量的分子生物學(xué)方法。其原理是將待測的DNA樣品固定在固相載體(硝酸纖維膜或尼龍膜)上,與標記的核酸探針進行雜交,在與...