Co-IP（免疫共沉淀）技術主要用于研究蛋白質之間的相互作用，其實驗設計如下：
1. 樣品準備：Co-IP實驗通常有兩種，一種是內源性蛋白相互作用驗證，一種是非內源性蛋白相互作用驗證。內源性相互作用通過質粒共轉染的方式將兩種蛋白轉染至同一細胞內表達；非內源性相互作用則是將含有靶蛋白的組織進行預處理及細胞裂解獲得細胞裂解液。
2. 沉淀誘餌蛋白：利用磁珠偶聯(lián)抗體沉淀誘餌蛋白。在樣品中加入磁珠偶聯(lián)抗體，抗體會與誘餌蛋白結合，利用磁鐵將磁珠拉下，同時誘餌蛋白會一起被沉淀出來。
3. SDS-PAGE及WB檢測：得到沉淀后，需要驗證沉淀中是否存在相互作用蛋白。先利用SDS-PAGE將蛋白復合物分離，隨后利用WB檢測是否存在靶蛋白。
4. 實驗對照設置：為了避免“假陽性”，需要設置正確的對照，包括陰性對照和陽性對照（Input組）。Input組為直接利用抗體對細胞裂解液進行WB檢測，驗證細胞裂解液中存在蛋白。
5. 結果真實性：確保共沉淀的蛋白是由所加入的抗體沉淀得到的，而并非外源非特異蛋白。使用單克隆抗體有助于避免污染的發(fā)生。
免疫沉淀技術IP實驗步驟。上海RIP免疫沉淀磁珠的選擇
免疫沉淀技術的實驗方法通常包括以下步驟：
1. 樣本準備
2. 細胞裂解：使用裂解緩沖液（含有蛋白酶抑制劑以防止蛋白質降解）裂解細胞，釋放蛋白質。
3. 蛋白質濃度測定：使用BCA、Bradford或Lowry等方法測定裂解液中蛋白質的濃度。
4. 抗體預處理：如果使用預固定的抗體，需先將抗體固定在固相支持物上，如瓊脂糖珠或磁性微珠。
5. 免疫沉淀反應：將裂解液與特異性抗體（固定或未固定）混合，并在4°C下緩慢搖晃孵育過夜，以允許抗體與目標蛋白質充分結合。
6. 固相支持物的回收：對于未固定的抗體，加入與抗體特異性結合的蛋白A或蛋白G結合的固相支持物。
7. 洗滌：去除未結合的蛋白質和雜質，通常需要多次洗滌固相支持物。
8. 洗脫：使用適當?shù)南疵摼彌_液（如加熱的SDS加載緩沖液或酸性緩沖液）從固相支持物上洗脫免疫復合物。
9. 后續(xù)分析：對洗脫的蛋白質進行SDS-PAGE電泳、Western Blot、質譜分析等，以進一步分析目標蛋白質。
10. 對照實驗：包括正對照（已知能沉淀目標蛋白的抗體）和負對照（非特異性抗體或無抗體）以驗證實驗的特異性。
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Co-IP的實驗步驟：
1. 細胞裂解：首先，細胞或組織被裂解，釋放其中的蛋白質。
2. 抗體結合：然后，將特異性抗體（針對已知蛋白質之一的抗體）加入到裂解物中。這些抗體會特異性地結合到目標蛋白（誘餌蛋白）上。
3. 免疫復合物形成：抗體與目標蛋白結合后，形成免疫復合物。
4. 沉淀：接著，使用蛋白A或蛋白G結合的珠子（如瓊脂糖或磁性珠子）來捕獲免疫復合物。蛋白A或蛋白G能夠與抗體的Fc部分結合，從而拉下抗體以及與之結合的目標蛋白和任何相關的相互作用蛋白。
5. 洗滌：捕獲的免疫復合物被洗滌以去除未特異性結合的蛋白質。
6. 洗脫和分析：免疫復合物被洗脫并進行進一步的分析，如Western blot（WB）或質譜分析，以鑒定相互作用的蛋白質。
免疫沉淀實驗步驟：
1. 樣品制備
a. 懸浮細胞樣品處理：離心收集細胞（4℃, 1000g, 5 min），用手指把細胞用力彈散。按照6孔板每孔細胞加入150-250 μL裂解液的比例加入含蛋白酶抑制劑的裂解液（裂解液應在使用前數(shù)分鐘內加入蛋白酶抑制劑Cocktail，使蛋白酶抑制劑Cocktail的終濃度為1×）?；靹蚝笾糜诒咸幚?0 min；離心收集上清液（4℃, 14000g, 10 min），置于冰上備用（或置于-20℃長期保存）。
b. 貼壁細胞樣品處理：移去培養(yǎng)基，用PBS清洗細胞兩遍；用細胞刮棒刮脫細胞，收集至1.5mL EP管內，按照6孔板每孔加入150-250 μL裂解液的比例加入含蛋白酶抑制劑的裂解液（裂解液應在使用前數(shù)分鐘內加入蛋白酶抑制劑Cocktail，使蛋白酶抑制劑Cocktail的終濃度為1×）。吹打數(shù)下，使裂解液和細胞充分接觸。混勻后置于冰上處理10 min；離心收集上清液（4℃, 14000g, 10 min），置于冰上備用（或置于-20℃長期保存）。
4. 后續(xù)：磁珠預處理——抗體吸附——抗原結合反應——抗體洗脫
免疫沉淀技術IP的優(yōu)缺點是什么？
RIP技術的優(yōu)勢在于：
1. 特異性：利用特異性抗體，可以精確地捕獲目標RNA結合蛋白及其相互作用的RNA。
2. 應用場景多：適用于研究RNA結合蛋白、miRNA、lncRNA等非編碼RNA與蛋白質的相互作用。
3. 技術結合：RIP后的RNA可以用于多種下游分析，如qPCR、測序等，為研究RNA的功能和調控提供了重要信息。
RIP技術的限制包括：
1. 抗體質量：需要高質量的特異性抗體，否則可能得到假陽性或假陰性結果。
2. 非特異性結合：可能存在非特異性結合問題，需要仔細的實驗設計和對照來控制。
免疫沉淀純化所得抗原純度低是什么原因？上海RIP免疫沉淀磁珠的選擇
免疫沉淀技術IP的實驗設計。上海RIP免疫沉淀磁珠的選擇
Co-IP（免疫共沉淀）技術主要用于研究蛋白質之間的相互作用，其應用場景如下：
1. 蛋白質相互作用網絡的鑒定：Co-IP可用于構建蛋白質相互作用網絡，發(fā)現(xiàn)目標蛋白的結合伙伴。
2. 信號傳導途徑的研究：通過Co-IP技術，科學家們發(fā)現(xiàn)了許多關鍵的細胞信號通路，如MAPK和PI3K/Akt通路等，為深入理解這些通路的功能和調控機制提供了重要線索。
3. 藥物靶點篩選：利用Co-IP技術，研究人員可以篩選潛在的藥物靶點。
疾病機制研究：通過分析疾病相關蛋白質的相互作用，Co-IP有助于揭示疾病的分子機制。
4. 抗體藥物開發(fā)：Co-IP可用于研究抗體藥物與其靶標蛋白的結合特性，評估抗體藥物的親和力和特異性。
5. 轉錄因子研究：Co-IP技術可以用于研究轉錄因子與蛋白質的相互作用，進而揭示基因調控網絡。
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