**近，空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究炙手可熱。細胞及其在組織樣本中的相對位置之間的關(guān)系對于理解疾病病理可能至關(guān)重要?？臻g轉(zhuǎn)錄組學(xué)是一項開創(chuàng)性的技術(shù)，它使科學(xué)家能夠測量組織樣本中的所有基因活性，并繪制出發(fā)生該活性的位置的圖。該技術(shù)已經(jīng)導(dǎo)致了新發(fā)現(xiàn)，這些新發(fā)現(xiàn)將有助于幫助科學(xué)家更好地了解生物過程和疾病。10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)可以應(yīng)用于**、免疫、發(fā)育、神經(jīng)和病理等研究方向。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項目執(zhí)行經(jīng)驗，致力通過質(zhì)量的服務(wù)，助力各位科研工作者取得新的突破?？臻g轉(zhuǎn)錄組避免了組織中細胞位置信息的丟失。陜西歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組報價

空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)原理是什么？當(dāng)組織冷凍切片附在空間轉(zhuǎn)錄組載片上時，條形碼引物結(jié)合并從組織中捕獲鄰近的mRNA。被捕獲的mRNA開始逆轉(zhuǎn)錄，得到的cDNA中包含了空間條形碼。分析Illumina測序結(jié)果中空間條形碼的序列，可以將每個mRNA轉(zhuǎn)錄的序列映射回組織切片中的起始位置?？臻g轉(zhuǎn)錄組的條形碼逆轉(zhuǎn)錄oligo(dT)引物在顯微鏡載玻片表面的有序附著，空間轉(zhuǎn)錄組使得在mRNA樣品處理和后續(xù)測序過程中位置信息的編碼和獲取成為可能。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項目執(zhí)行經(jīng)驗，致力通過質(zhì)量的服務(wù)，助力各位科研工作者取得新的突破。上海實力空間轉(zhuǎn)錄組盡管當(dāng)前空間轉(zhuǎn)錄組的數(shù)據(jù)在快速地增長，但尚未有對應(yīng)的數(shù)據(jù)庫來對這些數(shù)據(jù)進行匯總集成。

基于原位測序的空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)。基于原位測序（ISS）的方法通過測序產(chǎn)生空間轉(zhuǎn)錄組信息，這種方法只依靠連接酶連接兩段DNA—一段已知序列的引物和一個探針與模板匹配，不匹配的探針就會被洗掉。2013年開發(fā)的ISS中，每個探針使用一個查詢堿基來測序基因條形碼。FISSEQ和后來的EXeq使用了SOLiD，每個探針使用兩個查詢堿基來測序環(huán)化和RCA擴增的cDNAs。在STARmap中，基因條形碼由SEDAL測序，其中還使用了兩個類似固體的查詢堿基來避免錯誤。BARseq還用基因條形碼放大了RCA探針?；贗SS技術(shù)的優(yōu)勢包括：單細胞分辨率、亞細胞轉(zhuǎn)錄物定位和可應(yīng)用于更大的組織區(qū)域。缺點是：檢測效率較低。

10x  Genomics空間轉(zhuǎn)錄組用于文庫構(gòu)建的每張載玻片上有四個捕獲區(qū)域，每個捕獲區(qū)域的大小為6.5x6.5mm，包含5000個被條形碼標記的點（barcoded spots），每個點的直徑為55 μm，點和點之間中心的距離為100 μm，并且每個點都有一個barcode序列。組織切片的細胞中會釋放出mRNA，遷移到每個spot的mRNA會被標記上相應(yīng)的barcode序列，然后進行文庫構(gòu)建并進行測序。根據(jù)數(shù)據(jù)的條形碼信息對數(shù)據(jù)進行分析，以確定哪些數(shù)據(jù)來自哪個位置，從而實現(xiàn)空間基因表達的可視化。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項目執(zhí)行經(jīng)驗，致力通過高效的服務(wù)，助力各位科研工作者取得新的突破。了解R語言基礎(chǔ)語法及數(shù)據(jù)類型，了解空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析整體流程。

人類細胞圖譜項目的主要目標之一是描述所有細胞類型的空間關(guān)系。同時基于表達特征對多種細胞類型進行空間映射，有助于研究不同細胞類型之間的相互作用。已經(jīng)發(fā)展了一些策略來檢測單細胞分辨率的空間基因表達譜，如Slide-seq、seqFISH或MERFISH。為了更有效地為研究群體探索空間基因表達數(shù)據(jù)，我們構(gòu)建了SpatialDB數(shù)據(jù)庫用于空間解析的轉(zhuǎn)錄組。

人類細胞圖譜項目極大地推動了單細胞水平的生命科學(xué)研究?？臻g轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)的發(fā)展和空間基因表達數(shù)據(jù)的快速積累是未來的發(fā)展趨勢。我們將繼續(xù)收集新的技術(shù)和數(shù)據(jù)集來更新SpatialDB。此外，我們將整合更多的工具和數(shù)據(jù)源來分析數(shù)據(jù). 有很多其他類型的分析可用于空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)，包括基因模式的識別，空間區(qū)域的轉(zhuǎn)錄組定義等。運用空間轉(zhuǎn)錄組質(zhì)量

10X Visium空間轉(zhuǎn)錄組的實驗主要分為兩部分：組織學(xué)板塊和組學(xué)板塊。陜西歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組報價

一些實現(xiàn)空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)的重要技術(shù)，**早可以追溯到二十世紀七十年代，長期以來，各種形式的原位雜交技術(shù)（ISH）已用于可視化空間中的基因表達。從技術(shù)原理中不難看出，空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)**為特殊的載玻片。ISS 方法通常通過基于連接（SBL）或者基于合成（SBS） 的原位測序， 確定靶向基因序列或非靶向的 cDNA 短片段，**終獲得空間轉(zhuǎn)錄組信息。根據(jù)測序鏈接策略的不同（SOLiD，cPAL和SEDAL），基于 SBL 的原位測序技術(shù)方法的代表性技術(shù)分別為 FISSEQ，ISS，STARmap。陜西歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組報價

上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司主營品牌有歐易生物，發(fā)展規(guī)模團隊不斷壯大，該公司服務(wù)型的公司。公司致力于為客戶提供安全、質(zhì)量有保證的良好產(chǎn)品及服務(wù)，是一家私營合伙企業(yè)企業(yè)。公司擁有專業(yè)的技術(shù)團隊，具有科研服務(wù)，科研檢測，學(xué)術(shù)研究，技術(shù)咨詢等多項業(yè)務(wù)。歐易生物以創(chuàng)造***產(chǎn)品及服務(wù)的理念，打造高指標的服務(wù)，引導(dǎo)行業(yè)的發(fā)展。