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湖北歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組有什么用

來源: 發(fā)布時(shí)間:2021-11-12

10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)的準(zhǔn)確性高嗎?下圖是一個(gè)將10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)應(yīng)用于小鼠海馬體研究的案例。A圖為腦組織切片的HE染色結(jié)果,從10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果中,可以清晰看到Tmsb4x(B圖)和Selenow(C圖)在海馬體區(qū)域高表達(dá),和已知的研究結(jié)果一致性較高。開展10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組需要做哪些準(zhǔn)備?空間轉(zhuǎn)錄組是一項(xiàng)十分前沿的技術(shù),涉及到很多細(xì)節(jié)方面的準(zhǔn)備工作,例如組織類型的選擇、前期預(yù)實(shí)驗(yàn)的設(shè)計(jì)、病理區(qū)域的確認(rèn)等一系列內(nèi)容。而且實(shí)驗(yàn)中存在很多不確定性因素,處理不慎容易導(dǎo)致整個(gè)項(xiàng)目失敗??臻g轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果為未來人類心臟發(fā)育的研究提供重要的借鑒意義。湖北歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組有什么用

10x Genomics 公司提供的 Visium 空間基因表達(dá)解決方案是目前***一個(gè)高通量空間轉(zhuǎn)錄組的商業(yè)化解決方案。該解決方案巧妙的將單細(xì)胞測序技術(shù)原理和組織切片染色結(jié)合在一起,從而研究空間分辨率下整個(gè)轉(zhuǎn)錄組 mRNA 的表達(dá)情況,同時(shí)在同一組織切片中獲得組織學(xué)相關(guān)信息??臻g轉(zhuǎn)錄組相關(guān)的顯微解剖技術(shù)通常分為兩類:機(jī)械和光學(xué)。前者包括 Tomo-seq 等,通過沿感興趣軸,利用冷凍切片機(jī)進(jìn)行組織切片,然后在每個(gè)切片上均進(jìn)行 RNA 測序。10x 提供的載玻片分為兩種:用于摸索組織比較好透化時(shí)間的組織優(yōu)化玻片和用于正式實(shí)驗(yàn)的基因表達(dá)玻片。山西歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組使用對(duì)于 EDA 以外的任務(wù),用戶仍然經(jīng)常需要學(xué)習(xí)新的語法,轉(zhuǎn)換對(duì)象類型,空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)仍然面臨許多挑戰(zhàn)。

有哪些技術(shù)手段可以進(jìn)行空間轉(zhuǎn)錄組研究?已發(fā)表的關(guān)于空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)有Slide-seq , LCM-seq , seqFISH, MERFISH , Liver single cell zonation , Geo-seq and Tomo-seq。這些方法或是在細(xì)胞數(shù)量上限制較大,或是存在有效測序深度不足等問題。10x Genomics公司提供的Visium空間基因表達(dá)解決方案是目前較好的一個(gè)高通量空間轉(zhuǎn)錄組的商業(yè)化解決方案。該解決方案可以輕松地將空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)應(yīng)用到組織切片和染色的標(biāo)準(zhǔn)方法中,從而研究空間分辨率下整個(gè)轉(zhuǎn)錄組mRNA的表達(dá)情況,同時(shí)在同一組織切片中獲得組織學(xué)相關(guān)信息。

空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)包含兩種芯片,分別為組織優(yōu)化芯片(Tissue Optimization)和基因表達(dá)芯片(Library Preparation)。組織優(yōu)化芯片用來摸索組織透化的比較好時(shí)間,基因表達(dá)芯片用來進(jìn)行正式樣本的空間轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn)。其中基因表達(dá)芯片上有 4 個(gè)捕獲區(qū)域,每個(gè)區(qū)域大小為 6.5mm×6.5mm,每個(gè)捕獲區(qū)域中有 5000 個(gè)帶有特異地址序列的探針簇,稱為 barcoded spots,每個(gè) spot 直徑為 55um,包含數(shù)百萬個(gè)用于捕獲的 oligo 探針序列,相鄰兩個(gè) spot 的中心距離為 100um。探針序列的結(jié)構(gòu)為:測序引物結(jié)合序列,16nt 的位置序列,12nt 的 UMI 序列以及 30nt 的 oligo-dT 序列。如何通過“HE染色”判斷空間轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目樣本是否為“好的樣本”呢?

空間轉(zhuǎn)錄組的應(yīng)用有哪些?一、構(gòu)建空間轉(zhuǎn)錄組圖譜:借助于空間分辨的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué),建立圖譜可能是在分子水平上研究生物體結(jié)構(gòu)的重要步驟。目前的多項(xiàng)研究通過單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)結(jié)合空間轉(zhuǎn)錄技術(shù),得到多個(gè)***的時(shí)空轉(zhuǎn)錄組圖譜(相關(guān)研究后續(xù)會(huì)在如下專輯更新)。二、描繪胚胎發(fā)育和空間藍(lán)圖:胚胎發(fā)育是一個(gè)復(fù)雜的過程,其中動(dòng)態(tài)變化在生物分子水平上迅速發(fā)生。對(duì)這種微觀變化的時(shí)間和空間方面的分析都具有挑戰(zhàn)性。預(yù)期使用空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)可以表征胚胎發(fā)育的空間表達(dá)藍(lán)圖??臻g轉(zhuǎn)錄組避免了組織中細(xì)胞位置信息的丟失。山西歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組使用

通過空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)可獲取組織中具體的位置轉(zhuǎn)錄信息,為研究和診斷提供有效數(shù)據(jù)支撐。湖北歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組有什么用

隨著2020年離我們已經(jīng)越來越近,遵循政策導(dǎo)向,調(diào)整企業(yè)布局將成為未來企業(yè)戰(zhàn)略布局的重中之重。隨著我國醫(yī)藥健康深入推進(jìn)、“兩票制”進(jìn)一步推行,以及各項(xiàng)行業(yè)政策的出臺(tái),使得我國冷鏈物流市場規(guī)模不斷擴(kuò)大。對(duì)于冷鏈物流行業(yè)而言,“十三五”規(guī)劃時(shí)期是冷鏈物流調(diào)整和發(fā)展的關(guān)鍵時(shí)期。我國高度重視科研服務(wù),科研檢測,學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢的供應(yīng)保證工作,推動(dòng)研發(fā)和供應(yīng)保證也是深化醫(yī)藥衛(wèi)生體制改進(jìn)的重要任務(wù)。醫(yī)藥相關(guān)部門多次發(fā)布政策文件,鼓勵(lì)科研服務(wù),科研檢測,學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢的研發(fā)和生產(chǎn),提高醫(yī)藥的供應(yīng)保證能力。自2015年以來,健康科技成為醫(yī)藥健康私營合伙企業(yè)增長最快的領(lǐng)域。事實(shí)上,根據(jù)硅谷銀行的分析,有風(fēng)投支持的健康科技行業(yè)募資次數(shù)在這段時(shí)間增長了25%,硅谷銀行與其中大約40%的歐美公司進(jìn)行了合作。檢驗(yàn)檢測服務(wù)。(依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動(dòng),具體經(jīng)營項(xiàng)目以相關(guān)部門批準(zhǔn)文件或許可證件為準(zhǔn))一般項(xiàng)目:生物醫(yī)藥產(chǎn)品、生化產(chǎn)品的研發(fā),醫(yī)藥中間體、化工原料及產(chǎn)品(除危險(xiǎn)品化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、易制毒化學(xué)品)的研發(fā)、銷售,儀器儀表的銷售,并提供相關(guān)技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù),會(huì)務(wù)服務(wù),企業(yè)管理咨詢。是我國國民經(jīng)濟(jì)重要組成部分之一,具有高產(chǎn)出、高危險(xiǎn)、高技術(shù)密集型特點(diǎn),有很強(qiáng)的技術(shù)壁壘。而且對(duì)于保護(hù)和增進(jìn)大家健康、提高生活質(zhì)量,為計(jì)劃生育、救災(zāi)防疫、軍需戰(zhàn)備以及促進(jìn)經(jīng)濟(jì)發(fā)展和社會(huì)進(jìn)步均具有十分重要的作用。湖北歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組有什么用

上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司位于聯(lián)航路1188號(hào)25幢,是一家專業(yè)的檢驗(yàn)檢測服務(wù)。(依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動(dòng),具體經(jīng)營項(xiàng)目以相關(guān)部門批準(zhǔn)文件或許可證件為準(zhǔn))一般項(xiàng)目:生物醫(yī)藥產(chǎn)品、生化產(chǎn)品的研發(fā),醫(yī)藥中間體、化工原料及產(chǎn)品(除危險(xiǎn)品化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、易制毒化學(xué)品)的研發(fā)、銷售,儀器儀表的銷售,并提供相關(guān)技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù),會(huì)務(wù)服務(wù),企業(yè)管理咨詢。公司。在歐易生物近多年發(fā)展歷史,公司旗下現(xiàn)有品牌歐易生物等。公司堅(jiān)持以客戶為中心、檢驗(yàn)檢測服務(wù)。(依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動(dòng),具體經(jīng)營項(xiàng)目以相關(guān)部門批準(zhǔn)文件或許可證件為準(zhǔn))一般項(xiàng)目:生物醫(yī)藥產(chǎn)品、生化產(chǎn)品的研發(fā),醫(yī)藥中間體、化工原料及產(chǎn)品(除危險(xiǎn)品化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、易制毒化學(xué)品)的研發(fā)、銷售,儀器儀表的銷售,并提供相關(guān)技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù),會(huì)務(wù)服務(wù),企業(yè)管理咨詢。市場為導(dǎo)向,重信譽(yù),保質(zhì)量,想客戶之所想,急用戶之所急,全力以赴滿足客戶的一切需要。歐易生物始終以質(zhì)量為發(fā)展,把顧客的滿意作為公司發(fā)展的動(dòng)力,致力于為顧客帶來高品質(zhì)的科研服務(wù),科研檢測,學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢。

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