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山東小基因組完成圖小基因組測序多少錢

來源: 發(fā)布時間:2021-09-05

技術(shù)優(yōu)勢:

1. 業(yè)內(nèi)**的mtDNA&cpDNA富集抽提服務(wù):自主研發(fā)的細(xì)胞器基因組富集提取技術(shù),高效實現(xiàn)高質(zhì)量細(xì)胞器基因組富集。

2. 一對一的生物信息分析,人工基因注釋矯正:告別在線注釋平臺的偏差,滿足NCBI數(shù)據(jù)庫上傳要求,高質(zhì)量結(jié)果交付,助力高水平研究。

3. **技術(shù)團(tuán)隊負(fù)責(zé)人均9年以上從業(yè)經(jīng)驗,項目經(jīng)驗豐富,提供可以個性化方案定制。

4. 已完成葉綠體&線粒體基因組項目數(shù)百例,96%以上樣本實現(xiàn)完成圖水平交付。

5. 配套數(shù)據(jù)庫構(gòu)建服務(wù),提升科研水準(zhǔn),助力高水平研究發(fā)表。 小基因組測序樣本怎么制備呢?山東小基因組完成圖小基因組測序多少錢

標(biāo)準(zhǔn)分析:

1.測序數(shù)據(jù)概況

(1) 原始測序數(shù)據(jù)說明

(2) 測序數(shù)據(jù)質(zhì)控及統(tǒng)計

(3) 三代測序數(shù)據(jù)統(tǒng)計

2.基因組組裝

3. 基因組組分分析

(1) 編碼基因分析

(2) ORFs掃描及跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測

(3) 非編碼RNA分析

4. 基因功能注釋

 基因組圈圖

高級分析:


比較基因組分析

1.SNP檢測與注釋

2.Indel檢測與注釋

3.SV檢測

4.基因組共線性分析

5.線粒體與葉綠體基因組片段交流分析

6.共有和特有基因分析

7.系統(tǒng)進(jìn)化分析、選擇壓力分析

定制化生信分析

1.密碼子偏好性分析

2.長重復(fù)序列Long repeat分析

3.簡單重復(fù)序列SSR分析

4.基因表達(dá)量及表達(dá)差異分析(可由客戶提供RNAseq) 四川線粒體小基因組測序要多少錢小基因組測序的好處有很多。

基因組組裝:首先,利用ABySS v2.0.2初步組裝Illumina測序數(shù)據(jù),然后利用blasR比對Pacbio三代數(shù)據(jù),根據(jù)比對結(jié)果對單分子測序數(shù)據(jù)進(jìn)行一次矯正與糾錯,目的在于減少單分子長序列中單堿基、插入缺失的錯誤;***利用糾正過的單分子測序數(shù)據(jù)與二代數(shù)據(jù)進(jìn)行混合組裝,使用的軟件是SPAdes-3.10.1;挑選覆蓋深度足夠高且組裝長度較長的序列作為候選序列,比對NT庫確認(rèn);***再次利用Illumina數(shù)據(jù)進(jìn)行校驗,得到**終的組裝結(jié)果。基因組組分分析:通過多種方法對編碼基因、非編碼RNA等進(jìn)行預(yù)測,獲取測序樣本基因組的組成情況。

虎耳草科植物cpDNA的重復(fù)序列和熱點(diǎn)區(qū)域:O. rupifraga-BJCP cpDNA***鑒定出58個gSSRs。其中,44個位于LSC區(qū)域,而8個和6個分別位于IR和SSC區(qū)域。 在這些SSR中,43個mo**1個di-,4個tetra-。在O. rupifraga和M. rossii的葉綠體基因組中,分別檢測到15和17個正向重復(fù)序列序列(>30bp),3個葉綠體基因組中都檢測到17個回文重復(fù)序列。在cpDNA中同事檢測到60bp、61bp、62bp和79bp長重復(fù)序列。熱點(diǎn)區(qū)域?qū)殡S后的Oresitrophe和Mukdenia的系統(tǒng)地理學(xué)和分化歷史研究提供重要的遺傳信息。 小基因組測序的好處您了解嗎?

非編碼RNA分析:非編碼RNA(ncRNA)執(zhí)行多種生物學(xué)功能的RNA分子,其本身并不攜帶翻譯為蛋白質(zhì)的信息,直接在RNA水平對生命活動發(fā)揮作用。相比于“垃圾RNA”的舊觀念,人們開始認(rèn)識到生物體內(nèi)富含的這類RNA的無窮潛力。研究非編碼RNA不僅為了解生物體的基因表達(dá)調(diào)控系統(tǒng)和生長提供了重要信息。對于葉綠體而言,非編碼RNA的主要類型包括rrn5,rrn4.5,rrn16,rrn23;植物線粒體的非編碼RNA類型包括rrn5,rrn18,rrn26;***和動物線粒體的非編碼RNA類型包括rrnS,rrnL。云生物自主研發(fā)的Enrichment富集技術(shù),可降低核DNA污染,將總DNA中靶細(xì)胞器基因組比例提升。青海線粒體小基因組測序多少錢

云生物提供小基因組測序的質(zhì)檢報告嗎?山東小基因組完成圖小基因組測序多少錢

葉綠體基因組 | “**”遺傳資源開發(fā)新模式:葉綠體基因組結(jié)構(gòu)和特征:三個樣品的完整葉綠體基因組基本信息,包含由LSC(87,496-87,604bp)和SSC(18,222-18,342bp)區(qū)域分開的兩個IR拷貝(25,507-25,519bp)。編碼相同的131個基因組,其中113個是獨(dú)特的,18個在IR區(qū)域中重復(fù)。113個獨(dú)特的基因包含79個蛋白質(zhì)編碼基因,30個tRNA基因和4個rRNA基因。14個含有一個內(nèi)含子(6個tRNA基因和8個蛋白質(zhì)編碼基因),3個含有兩個內(nèi)含子(rps12,clpP,ycf3)。 rps12基因的5'-末端外顯子位于LSC區(qū)域,基因的內(nèi)含子和3'-末端外顯子位于IR區(qū)域。山東小基因組完成圖小基因組測序多少錢

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