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湛江熒光定量qPCR儀應(yīng)用

來源: 發(fā)布時間:2023-06-07

所謂實時熒光定量PCR技術(shù),是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團,利用熒光信號積累實時監(jiān)測整個PCR進程,通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知模板進行定量分析的方法。實時熒光定量PCR (Quantitative Real-time PCR)是一種在DNA擴增反應(yīng)中,以熒光化學(xué)物質(zhì)測每次聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法。通過內(nèi)參或者外參法對待測樣品中的特定DNA序列進行定量分析的方法。·Real-timePCR是在PCR擴增過程中,通過熒光信號,對PCR進程進行實時檢測。由于在PCR擴增的指數(shù)時期,模板的Ct值和該模板的起始拷貝數(shù)存在線性關(guān)系,所以成為定量的依據(jù)。Quantagene q225 系列熒光定量PCR 系統(tǒng)主要特點:精確定量、快速高效、小巧輕便。湛江熒光定量qPCR儀應(yīng)用

傳統(tǒng)定量PCR方法簡介:1)內(nèi)參照法:在不同的PCR反應(yīng)管中加入已定量的內(nèi)標(biāo)和引物,內(nèi)標(biāo)用基因工程方法合成。上游引物用熒光標(biāo)記,下游引物不標(biāo)記。在模板擴增的同時,內(nèi)標(biāo)也被擴增。在PCR產(chǎn)物中,由于內(nèi)標(biāo)與靶模板的長度不同,二者的擴增產(chǎn)物可用電泳或高效液相分離開來,分別測定其熒光強度,以內(nèi)標(biāo)為對照定量待檢測模板。2)競爭法:選擇由突變克隆產(chǎn)生的含有一個新內(nèi)切位點的外源競爭性模板。在同一反應(yīng)管中,待測樣品與競爭模板用同一對引物同時擴增(其中一個引物為熒光標(biāo)記)。擴增后用內(nèi)切酶消化PCR產(chǎn)物,競爭性模板的產(chǎn)物被酶解為兩個片段,而待測模板不被酶切,可通過電泳或高效液相將兩種產(chǎn)物分開,分別測定熒光強度,根據(jù)已知模板推測未知模板的起始拷貝數(shù)。3)PCR-ELISA法:利用地高辛或生物素等標(biāo)記引物,擴增產(chǎn)物被固相板上特異的探針?biāo)Y(jié)合,再加入抗地高辛或生物素酶標(biāo)抗體-辣根過氧化物酶結(jié)合物,終酶使底物顯色。常規(guī)的PCR-ELISA法只是定性實驗,若加入內(nèi)標(biāo),作出標(biāo)準(zhǔn)曲線,也可實現(xiàn)定量檢測目的。上海高效qPCR儀消毒SYBR Green是一種DNA插入染料用于qPCR。雖然SYBR Green方法比探針方法便宜,但是特異性沒有熒光探針方法好。

合成引物時需注意:在設(shè)計PCR引物時,首先確定要擴增的DNA區(qū)域,并設(shè)計一對專門位于目標(biāo)區(qū)域的引物,一個在正向鏈上,另一個在反向鏈上。引物須具有特異性,避免擴增出非特異性片段。正向引物與反向引物應(yīng)具有相似的退火溫度,GC含量與退火溫度相關(guān),調(diào)整引物長度可以改變退火溫度。避免引物序列有二級結(jié)構(gòu)或引物二聚體,會降低PCR效率。許多的在線工具可用于輔助引物設(shè)計。PCR擴增包括三組被設(shè)定好的時間和溫度,步驟為:變性,退火和延伸1、變性:PCR的第一步稱為變性,將模板DNA加熱到95°C幾秒鐘,將兩條DNA鏈分開,使它們之間的氫鍵迅速斷裂。2、退火:反應(yīng)混合物冷卻30秒至1分鐘。退火溫度通常為50-65°C,但確切的比較好溫度取決于引物的長度和順序。不同的引物可能具有不同的退火溫度。3、延伸:溫度升至混合物中存在的DNA聚合酶的理想工作溫度,通常約為72°C。DNA聚合酶附著在每個引物的一端,并合成與模板DNA互補的DNA新鏈。

實時熒光定量PCR所使用的熒光物質(zhì)可分為兩種:熒光探針和熒光染料?,F(xiàn)將其原理簡述如下:1. TaqMan熒光探針:PCR擴增時在加入一對引物的同時加入一個特異性的熒光探針,該探針為一寡核苷酸,兩端分別標(biāo)記一個報告熒光基團和一個淬滅熒光基團。探針完整時,報告基團發(fā)射的熒光信號被淬滅基團吸收;PCR擴增時,Taq酶的5'-3'外切酶活性將探針酶切降解,使報告熒光基團和淬滅熒光基團分離,從而熒光監(jiān)測系統(tǒng)可接收到熒光信號,即每擴增一條DNA鏈,就有一個熒光分子形成,實現(xiàn)了熒光信號的累積與PCR產(chǎn)物形成完全同步。2. SYBR熒光染料:在PCR反應(yīng)體系中,加入過量SYBR熒光染料,SYBR熒光染料非特異性地?fù)饺隓NA雙鏈后,發(fā)射熒光信號,而不摻入鏈中的SYBR染料分子不會發(fā)射任何熒光信號,從而保證熒光信號的增加與PCR產(chǎn)物的增加完全同步。SYBR與雙鏈DNA進行結(jié)合,因此可以通過溶解曲線,確定PCR反應(yīng)是否特異。3.分子信標(biāo):是一種在5和3末端自身形成一個8個堿基左右的發(fā)夾結(jié)構(gòu)的莖環(huán)雙標(biāo)記寡核苷酸探針,兩端的核酸序列互補配對,導(dǎo)致熒光基團與淬滅基團緊緊靠近,不會產(chǎn)生熒光。PCR產(chǎn)物生成后,退火過程中,分子信標(biāo)中間部分與特定DNA序列配對,熒光基因與淬滅基因分離產(chǎn)生熒光。qPCR只能實現(xiàn)相對定量,即必須使用標(biāo)準(zhǔn)品生成標(biāo)準(zhǔn)曲線,才能進行定量。

TaqMan qPCR:該測定不使用嵌入染料,而是使用帶有 5' 熒光報告染料和 3' 淬滅染料的 TaqMan 探針。 這些探針是目標(biāo)特異性的,并且在退火步驟中與引物之一下游的目標(biāo) DNA 序列結(jié)合。 當(dāng) Taq 聚合酶在延伸階段遇到 TaqMan 探針時,它會置換并切割 5' 報告染料。 一旦報告染料與淬滅染料分離,其在每個 qPCR 循環(huán)結(jié)束時的可測量熒光信號就會顯著增加。 第二條 DNA 鏈?zhǔn)瞧叫泻铣傻模捎跊]有探針附著在它上面,因此無法通過熒光測量來監(jiān)測這一過程。與 SYBR Green 檢測相比,使用 TaqMan 探針的成本更高,但也具有兩個顯著優(yōu)勢:TaqMan 檢測測量目標(biāo)序列的擴增進程,因為探針是目標(biāo)特異性的。您可以通過向主混合物中添加不同的引物和具有不同報告染料的 TaqMan 探針來監(jiān)測單個反應(yīng)中各種 qPCR 產(chǎn)物的數(shù)量。 這種多重方法允許您在每個熱循環(huán)結(jié)束時檢測多個熒光信號。qPCR面對小的差異較弱,dPCR則可識別差異較小的拷貝數(shù)。珠海Quantagene q225qPCR儀消毒

利用外標(biāo)準(zhǔn)曲線的實時熒光定量PCR是迄今為止定量準(zhǔn)確,重現(xiàn)性比較好的定量方法,已得到全世界的公認(rèn)。湛江熒光定量qPCR儀應(yīng)用

qpcr的檢測原理:qPCR主要是使用插入染料或熒光探針(例如TaqMan),利用實時積累的熒光信號監(jiān)測整個擴增過程,然后通過標(biāo)準(zhǔn)曲線來對未知模板進行定量分析。qPCR 主要是依賴于標(biāo)準(zhǔn)品制備標(biāo)準(zhǔn)曲線,進而去確定未知樣品的濃度,因此是一種相對定量的方法。隨著PCR的循環(huán)進行,染料熒光強度增加,從而檢測到定量反應(yīng)的DNA。SYBR Green是一種DNA插入染料,范圍廣用于qPCR。雖然SYBR Green方法比探針方法便宜,但是特異性沒有熒光探針方法好。湛江熒光定量qPCR儀應(yīng)用

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