高通量BSP——目標位點/基因甲基化驗證方案?？茖W方案：設(shè)計從項目背景了解、協(xié)助方案設(shè)計、實驗材料選取、建庫測序，到數(shù)據(jù)分析每個項目有特定的科學問題；需要專業(yè)、有價值的建議；科學、縝密的設(shè)計及時高效的溝通；以保障高質(zhì)量研究成果。樣本要求：基因組DNA:>=1ug(20個區(qū)域/位點)；樣品濃度>30ng/ul；無RNA和蛋白污染建庫測序：測序策略：IlluminaHiSeq,PE150；測序深度：>100X。信息分析：基于靶向序列的甲基化分析，數(shù)據(jù)質(zhì)控，5mCCalling，5mC在組間樣本的可視化，多樣本甲基化聚類與臨床樣本特征關(guān)聯(lián)分析等。芯片平臺作為目前比較成熟的篩選工具。四川hMeDIP-SeqDNA甲基化怎么樣
安捷倫公司芯片平臺因其強大的eArray探針設(shè)計平臺，可以進行芯片的定制。在甲基化領(lǐng)域同樣適用。合作伙伴利用Agilent芯片平臺設(shè)計了一款專門針對**啟動子區(qū)域CpG島的甲基化芯片。絕大多數(shù)基因是針對基因的啟動子區(qū)域的CpG島設(shè)計探針。這款芯片上一共有4160個功能注釋比較明確的基因，其中2128個和**發(fā)生有關(guān)系。從功能上分，有256基因和細胞凋亡有關(guān)，1273個基因和信號傳導有關(guān)，487個基因和壓力和衰老有關(guān)。采用的是8*60K的芯片格式。利用MeDIP原理進行甲基化檢測的方法探針的分辨率可以精確到100 bp。重慶850K芯片DNA甲基化經(jīng)驗豐富焦磷酸測序技術(shù)是甲基化檢測新的金標準。
重亞硫酸鹽處理結(jié)合測序是目前檢測甲基化的金標準。除了全基因組甲基化測序技術(shù)等研究手段，對于大樣本量甲基化研究來說，更需要靈活、有針對性的技術(shù)方案。NGS-BSP方法適合幾個到幾十個基因或者位點進行大樣本甲基化測序或者驗證項目，具有更快速的實驗周期及低成本優(yōu)勢。單堿基分辨率針對目標序列，非常靈活適合多種樣本類型應(yīng)用方向：450K/850K芯片篩選的差異甲基化CpG位點(DMS)。技術(shù)優(yōu)勢：高效靈活的目標區(qū)域甲基化檢測的工具BSP和高通量測序完美結(jié)合，單堿基分辨率適合幾個到幾十個位點的大樣本驗證項目適合所有動物樣本、周期快、檢測位點靈活、性價比高。
甲基化研究項目各學科細分分析：從各學科細類中標金額和中標數(shù)量分析，**學依然是甲基化研究的熱點方向，該方向總計中標金額2217萬元，中標數(shù)量57項。其它細分學科包括預防醫(yī)學、遺傳學與生物信息學、檢驗醫(yī)學也占有不少份額。甲基化研究項目各單位中標情況分析：經(jīng)過整理，甲基化項目類中標單位共105家單位，按中標項目金額排列如下（截取部分超過百萬的項目）。甲基化研究方向細分熱點分析："游離DNA甲基化"、"m6A-RNA甲基化"，“羥甲基化”等均是甲基化研究方向的重點關(guān)注內(nèi)容。尤其值得關(guān)注的是m6A相關(guān)研究近年來呈直線上升態(tài)勢，成為國自然的熱點。甲基化驗證方案是TBS。
全基因組甲基化測序（Whole Genome Bisulfite Sequencing, WGBS）是將重亞硫酸鹽Bisulfite處理和高通量測序技術(shù)相結(jié)合，對有參考基因組進行全基因組范圍的單堿基分辨率的甲基化測序，是DNA甲基化檢測的“金標準”。WGBS滿足全基因組DNA甲基化圖譜及疾病關(guān)聯(lián)分析、基因調(diào)控分析、疾病的甲基化標志物篩選等探索性課題的研究。技術(shù)優(yōu)勢：DNA甲基化檢測**有力的工具，單堿基分辨率，檢測每個C堿基的甲基化狀態(tài)，全基因組范圍，**限度地獲得甲基化信息，適合所有有參考基因組的物種適合各種類型的樣本。云生物提供測序服務(wù)。遼寧6mADNA甲基化售后服務(wù)
甲基化驗證是甲基化研究必不可少的一環(huán)。四川hMeDIP-SeqDNA甲基化怎么樣
甲基化DNA免疫沉淀測序（MethylatedDNAImmunoprecipitationSequencing，MeDIP-Seq）是通過5mC特異性抗體富集甲基化的DN**段，然后結(jié)合高通量測序技術(shù)在全基因組水平上以較小的數(shù)據(jù)量，快速、高效地尋找甲基化區(qū)域?？蓮V泛應(yīng)用于甲基化與疾病關(guān)系研究。技術(shù)優(yōu)勢：全基因組范圍鑒定甲基化修飾區(qū)域，針對性檢測基因組內(nèi)具有甲基化修飾的區(qū)域，與WGBS技術(shù)相比，成本更低?？茖W方案設(shè)計從項目背景了解、協(xié)助方案設(shè)計、實驗材料選取、建庫測序，到數(shù)據(jù)分析每個項目有特定的科學問題；需要專業(yè)、有價值的建議；科學、縝密的設(shè)計及時高效的溝通；以保障高質(zhì)量研究成果。四川hMeDIP-SeqDNA甲基化怎么樣